Projects:bioluminescence

Aims

Isoler des organismes luminescents de poissons de mer et les utiliser comme "encre lumineuse" sur des objets designs

Peut-être une définition: "la bioluminescence se définit par la production et l’émission de lumière par un organisme, indépendamment de la lumière environnante au moment de la production. Cette réaction biochimique s’effectue entre un substrat et une enzyme, respectivement la luciférine et la luciférase. L'oxydation de la luciférine en présence de luciférase produit un photon qui sera à l’origine de la lumière émise (ainsi qu'une molécule inactive, l'oxyluciférine)." -la bioluminescence

Deux familles de bactéries, les Vibrionacées et les Entérobactériacées présentent des représentants luminescents. Il s’agit de bactéries non pathogènes pour l’homme utilisées au niveau scolaire dans plusieurs pays notamment pour l’étude de la bioluminescence. On peut les acheter et faire des cultures : - UTILISATION PEDAGOGIQUE DE BACTERIES LUMINESCENTES

Il existe des champignons aussi.

Il est possible de créer des souches luminescentes mais il faut manipluer les bactéries ce qu'on est pas autorisé à faire dans notre labo.

Il y a la chimiluminescence qui est assimilée à la bioluminescence : bien que la bioluminescence soit un phénomène naturel et seulement présent dans le monde animal, l'homme a réussit à créer une alternative à ce phénomène: la chimiluminescence. Ce nom se réfère à une réaction chimique entraînant une émission de lumière froide. La réaction du luminol avec le peroxyde d’hydrogène est la plus souvent utilisée pour produire de la chimiluminescence et peut-être assimilée à celle de la bioluminescence. - la bioluminescence

Inspiration

• hackteria bioluminescence page
• la paillasse visual compendium of glowing creatures

Ongoing Lab Notebook

Isolation of bacteria from sea fish

Materials

   Fish enrichment medium from hackteria.org

   for 1L
   250g fish
   30g NaCl
   10g peptone
   10ml glycerol
   1g yeast extract
   15g agar (or agar agar) * For a solid medium add 15–20 g of agar to every litre of broth.

   pH paper
   coffee filter
   funnel
   erlenmeyer flask 2x 1L or something that can stand autoclaving, and is no more than 70% in volume full

   1. Boil 250 g fish meat in 1 l of water. 
   2. Add 30 g NaCl (make sure there is no anti-coagulant) and sieve to remove solids. 
   3. Add 10 g peptone, 10 ml glycerol and 1 g yeast extract. 
   4. Adjust the pH to 7. 
   5. Autoclave at 121 °C for 15–20 minutes.

Source of Organisms

Try crab shells

Fish - which sea fish? This website discusses the sources, and the biosafety aspects of isolating these organisms.

Making of a Dark Cabinet

Cabinet with dark curtains

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2014.10.29	User:hekkcess is setting up the box that will become the dark room
2014.11.12	The dark room is set up - thanks, User:hekkcess ! The drawers have been cleaned and the material gathered!

Preparation of Media

2014.10.30	Glycerol bought in Amavita Pharmacy Lausanne.
2014.10.31	Bought "sel marin iodé" and "cenovis" in Coop. In Coop, we can buy whole fresh (on ice, not frozen) sea fishes (ungutted fishes) : mackerel (maqueraud) and see bream (daurade).
2014.11.01	Bought Proteins in Sun Store Lausanne. Got an old blanket for the dark room setting.
2014.12.03	Made 1L of solid medium. 165 g fish meat boiled in 500 ml water (cabillaud) 30 g NaCl added ( solids removed) 14.4 g peptone, 10 ml glycerol and 1,4g yeast extract added. solution was adjusted to 1L (water) solution was filtered pH was already 7 15 g agar added Autoclave at 121 °C for 15–20 minutes.