Bience - Revision history

Romain: /* Résultat */

2016-03-24T13:25:42Z

Résultat

Romain: /* Procédure de test */

2016-03-24T13:23:59Z

Procédure de test

Romain: /* Principe */

2016-03-24T12:48:45Z

Principe

Romain at 12:46, 24 March 2016

2016-03-24T12:46:04Z

Romain: /* Détection d'infection */

2016-03-23T13:06:18Z

Détection d'infection

Romain at 13:04, 23 March 2016

2016-03-23T13:04:01Z

Romain at 12:54, 23 March 2016

2016-03-23T12:54:20Z

Romain at 12:51, 23 March 2016

2016-03-23T12:51:22Z

Romain at 12:49, 23 March 2016

2016-03-23T12:49:22Z

Romain at 12:48, 23 March 2016

2016-03-23T12:48:36Z

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 ==Résultat==
 [[File:S-23_survie2.png|300px|thumb|right|'''Fig. 1.''' Survie de la S-23 après réhydratation. Nombre de cellules vivantes par ml en fonction de différents temps de réhydratation. La ligne rouge représente la quantité théorique en fonction du poids de levure sèche utilisée.]]
-On observe un pic à 2h sous incubation. Ce que cette expérience indique surtout, est que le temps de rehydratation n'a pas une très grande influence sur la survie. Il est donc possible de garder les levures dans le yeast tank au moins pendant 4 heures sans effet néfaste.
+On observe un pic à 2h sous agitation. Ce que cette expérience indique surtout, est que le temps de rehydratation n'a pas une très grande influence sur la survie. Il est donc possible de garder les levures dans le yeast tank au moins pendant 4 heures sans effet néfaste.
 = Prototype pour mesurer un volume de gas =

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 ===Procédure de test===
 '''Méthode'''<br>
-Le contenu de la bouteille ou de la cuve suspecte est dilué 10x puis 50 μl sont étalés sur une plaque LMDA contenant du cycloheximide et sur une plaque LMDA sans cycloheximide. Dans le cas d'un test sur une cuve, le contenu du tube contrôle est aussi testé de la même façon. Attendre ensuite 2 jours et analyser les résultats.<br><br>
+Le contenu de la bouteille ou de la cuve suspecte est dilué (peut varier selon l'échantillon et peut être adapté selon les résultats) 10x et 1000x puis 50 μl de 10x sont étalés sur une plaque LMDA contenant du cycloheximide et 50 ul de 1000x sur une plaque LMDA sans cycloheximide. Dans le cas d'un test sur une cuve, le contenu du tube contrôle est aussi testé de la même façon. Attendre ensuite 2 jours et analyser les résultats.<br><br>
 '''Interprétation'''<br>
 ''Pas d'infection :'' La plaque sans cycloheximide montre une quantité de colonies attendues et uniformes. Le milieu garde reste bien bleu. Rien ne pousse sur la plaque avec cycloheximide.<br>

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 == Culture solide ==
 ===Principe===
-La culture sur plaque est un outil indispensable au bon Bientifique. Ces cultures permettent de répondre à un grand nombre de questions allant du nombre de cellules effectif d'une culture liquide, à la détection et l'identification des infections. Il existe un grand nombre de milieux différents en fonction des besoins. Ici, nous parlerons surtout de ceux que nous utilisons à la Nébuleuse. Principalement, nous utilisons un milieu à base de malt extract (de moût) dans lequel on ajoute du yeast extract maison, de l'agar et une pointe de sulfate de zinc.
+La culture sur plaque est un outil indispensable au bon Bientifique. Ces cultures permettent de répondre à un grand nombre de questions allant du nombre de cellules effectif d'une culture liquide, à la détection et l'identification des infections. Il existe un grand nombre de milieux différents en fonction des besoins. Ici, nous parlerons surtout de ceux que nous utilisons à la Nébuleuse. Principalement, nous utilisons un milieu à base de malt extract (de moût) dans lequel on ajoute du yeast extract maison, de l'agar et une pointe de sulfate de zinc. Ce milieu très basique permet de faire pousser un peu près tous les organismes trouvés dans une brasserie. Il manque cependant de methode séléctive permettant la démarquation et l'identification des différentes souches. Le milieu LMDA possède ces attout et est décrit dans la partie "Détection d'infections".
 ===Milieu basic: Recette===

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 [[File:Bience at work WEsessions.jpg|500px|thumb|none|alt=A| Luc visite la brasserie avec Kouros et Romain pour mieux comprendre le matériel réel utilisé en phase de fermentation.]]
 = Techniques utiles à la Bience =
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 ''Possible infection d'une autre souche de levure :'' La plaque sans cycloheximide montre un trop grand nombre de colonies de formes diverses et/ou un halo jaune apparait autour de certaines colonies. Rien ne pousse sur la plaque avec cycloheximide.<br>
 Dans ce dernier cas de figure une observation au microscope ainsi que de nouvelles plaques en isolant chaque colonie est nécessaires pour confirmer une infection. On sait cependant qu'il ne s'agit pas de bactérie car rien n'a poussé avec cycloheximide. Il s'agit donc possiblement d'une autre souche de levure issue d'une cross-contamination ou eventuellement d'une levure sauvage sensible au cycloheximide.

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 ===Principe===
 Il est très important d'avoir un moyen de détecter la présence d'autre microorganismes que la levure dans les cultures de levure, dans le moût et dans la bière après fermentation. Certaines bactéries produisent directement des off-flavors d'elles-même comme les lactobacilles alors d'autres induisent les levures présentes à produire des off-flavors. La bière est un environnement hostile pour la plupart des microorganismes (pH bas, éthanol, peu d'oxygène et beaucoup de CO2.) Les principaux microorganismes capable de croître dans la bière sont les suivants (liste non exhaustive) : <br><br>
-[[File:pylogenic tree of beer species.jpg]]
+[[File:pylogenic tree of beer species.jpg|thumb|right|200px|Espèces trouvées dans la bière, qu'elles soient néfastes ou voulues. Séparées ici par distance phylogénétique.]]
 '''Gram-Positive Bacteria'''<br>
 - Lactobacillus spp.<br>

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 Ce projet très sérieux a été '''initié par nos voisins, les brasseurs de [[La Nébuleuse]]''', qui veulent mieux comprendre comment fonctionnent les levures qu’ils utilisent pour fabriquer leurs produits. Avec l’aide des biologistes de l’association, ils vont apprendre à dompter ces petites bêtes à Hackuarium.<br>
 Le projet a été présenté lors de l' [[Openhackuarium vol. 57 "Bière"]] (pas mal de détails sur la page discussion : [[Talk:Openhackuarium_vol._57_"Bière"]])
-[[File:Phylogenic tree of beer species.png|500px|thumb|right| Arbre phylogénétique des espèce que l'on trouve dans la bière. Néfastes et voulues.]]
 = Premiers WE de travail =
 [[File:Bience at work WEsessions.jpg|500px|thumb|none|alt=A| Luc visite la brasserie avec Kouros et Romain pour mieux comprendre le matériel réel utilisé en phase de fermentation.]]
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 ===Principe===
 Il est très important d'avoir un moyen de détecter la présence d'autre microorganismes que la levure dans les cultures de levure, dans le moût et dans la bière après fermentation. Certaines bactéries produisent directement des off-flavors d'elles-même comme les lactobacilles alors d'autres induisent les levures présentes à produire des off-flavors. La bière est un environnement hostile pour la plupart des microorganismes (pH bas, éthanol, peu d'oxygène et beaucoup de CO2.) Les principaux microorganismes capable de croître dans la bière sont les suivants (liste non exhaustive) : <br><br>
 '''Gram-Positive Bacteria'''<br>
 - Lactobacillus spp.<br>