Projects:bioluminescence
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Aims
Isoler des organismes luminescents de poissons de mer et les utiliser comme "encre lumineuse" sur des objets designs
- Peut-être une définition: "la bioluminescence se définit par la production et l’émission de lumière par un organisme, indépendamment de la lumière environnante au moment de la production. Cette réaction biochimique s’effectue entre un substrat et une enzyme, respectivement la luciférine et la luciférase. L'oxydation de la luciférine en présence de luciférase produit un photon qui sera à l’origine de la lumière émise (ainsi qu'une molécule inactive, l'oxyluciférine)." -la bioluminescence
- Deux familles de bactéries, les Vibrionacées et les Entérobactériacées présentent des représentants luminescents. Il s’agit de bactéries non pathogènes pour l’homme utilisées au niveau scolaire dans plusieurs pays notamment pour l’étude de la bioluminescence. On peut les acheter et faire des cultures : - UTILISATION PEDAGOGIQUE DE BACTERIES LUMINESCENTES
- Deux familles de bactéries, les Vibrionacées et les Entérobactériacées présentent des représentants luminescents. Il s’agit de bactéries non pathogènes pour l’homme utilisées au niveau scolaire dans plusieurs pays notamment pour l’étude de la bioluminescence. On peut les acheter et faire des cultures : - UTILISATION PEDAGOGIQUE DE BACTERIES LUMINESCENTES
- Il existe des champignons aussi.
- Il est possible de créer des souches luminescentes mais il faut manipluer les bactéries ce qu'on est pas autorisé à faire dans notre labo.
- Il y a la chimiluminescence qui est assimilée à la bioluminescence : bien que la bioluminescence soit un phénomène naturel et seulement présent dans le monde animal, l'homme a réussit à créer une alternative à ce phénomène: la chimiluminescence. Ce nom se réfère à une réaction chimique entraînant une émission de lumière froide. La réaction du luminol avec le peroxyde d’hydrogène est la plus souvent utilisée pour produire de la chimiluminescence et peut-être assimilée à celle de la bioluminescence. - la bioluminescence
Inspiration and Reference
- hackteria bioluminescence page
- la paillasse visual compendium of glowing creatures
- Isolation of Pure Cultures Of Bacteria Vibrio phosphoreum from Squid or Ocean Fish has a nice list of what temperatures to grow for what species
People Involved
Ongoing Lab Notebook
Isolation of bacteria from sea fish
Materials
Fish enrichment medium from hackteria.org
for 1L 250g fish 30g NaCl 10g peptone 10ml glycerol 1g yeast extract 15g agar (or agar agar) * For a solid medium add 15–20 g of agar to every litre of broth.
pH paper coffee filter funnel erlenmeyer flask 2x 1L or something that can stand autoclaving, and is no more than 70% in volume full
1. Boil 250 g fish meat in 1 l of water. 2. Add 30 g NaCl (make sure there is no anti-coagulant) and sieve to remove solids. 3. Add 10 g peptone, 10 ml glycerol and 1 g yeast extract. 4. Adjust the pH to 7. 5. Autoclave at 121 °C for 15–20 minutes.
Source of Organisms
- Try crab shells
- Fish - which sea fish? This website discusses the sources, and the biosafety aspects of isolating these organisms.
Making of a Dark Cabinet
Cabinet with dark curtains
| 2014.10.29 | hekkcess is setting up the box that will become the dark room |
| 2014.11.12 | The dark room is set up - thanks, hekkcess ! The drawers have been cleaned and the material gathered! |
Preparation of Media
| 2014.10.30 | Glycerol bought in Amavita Pharmacy Lausanne. |
| 2014.10.31 | Bought "sel marin iodé" and "cenovis" in Coop. In Coop, we can buy whole fresh (on ice, not frozen) sea fishes (ungutted fishes) : mackerel (maqueraud) and see bream (daurade). |
| 2014.11.01 | Bought Proteins in Sun Store Lausanne. Got an old blanket for the dark room setting. |
| 2014.12.03 | Made 1L of solid medium.
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